Data-science
In medisch-microbiologische laboratoria in Nederland is in toenemende mate behoefte aan goede en betrouwbare inhoudelijke data-analyses. Om data-gedreven te kunnen opereren, is het nodig te beschikken over kwalitatief goede data, een juist ingerichte structuur en data-experts met vakinhoudelijke kennis. ‘Data-expert’ is hier een overkoepelende term voor functies als epidemioloog, data scientist en bioinformaticus. De afdeling MMI zorgt met dit team dat we onze data goed op orde hebben.
Juiste data maken het mogelijk om:
- Nieuwe laboratoriumprocessen te evalueren
- Antibioticumresistentie te monitoren
- Therapiekeuze te ondersteunen
- Spiegelinformatie terug te koppelen aan aanvragers
- Kwaliteit te waarborgen
- Surveillance en infectiepreventie mogelijk te maken.
(Meta)Genomics data
Daarnaast spelen bio-informatici een cruciale rol in het verwerken en interpreteren van complexe (meta)genomics data, met een bijzondere focus op microbioom-onderzoek. Door geavanceerde algoritmes, machine learning en statistische methoden toe te passen, kunnen bio-informatici inzicht bieden in microbiële diversiteit, functionele interacties binnen het microbioom en de impact van externe factoren zoals antibioticagebruik en dieet. Hun expertise maakt het mogelijk om niet alleen individuele pathogenen te bestuderen via genoomsequenties, maar ook om bredere patronen in microbiële ecosystemen te ontdekken, wat bijdraagt aan diagnostiek, infectiepreventie en innovatieve behandelstrategieën.
Team
Het data-team van MMI bestaat uit:
Contactgegevens
E: data-science.mmi@mumc.nl
T: 043 387 6644